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什么是人体微生物组计划

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留学那点儿事

作为与人类共生的生命体,人体中的微生物都是以万亿数量级进行统计的。

它们与生俱来,甚至我们出生时也携带着从母亲获得的菌群。它们与人类共进退,但我们却对如此忠诚的伙伴所知甚少。在2007年,美国国立卫生研究院一声令下,诞生了史上最大的人体微生物探索项目——人类微生物组计划(HMP)。在过去十几年中,科学界在人类微生物研究上投入了超过17亿美元的资金,大部分相关的课题研究都来自于美国、欧洲、中国等地区。如此庞大的资金和研究链无不体现了科学家对人体微生物的关注。此前微生物学界也获得了不少突破性的进展,例如新生儿会从母亲获得关键性的微生物群;乳汁中无法消化的糖类可以促进婴儿肠胃中微生物的生长,而微生物成长后,又可以反过来增强婴儿免疫系统功能。但遗憾地是,这些零散的研究很难理清微生物群体、人体以及疾病这三者的关系。但这一尴尬的局面在21世纪初期出现了转折,2005年开始,DNA测序技术的成本逐渐开始下降,美国国立卫生研究院(NIH)决定开展针对人体微生物群体的大型研究计划。

2007年,美国投入了2亿美元启动了庞大的人类微生物组计划(Human Microbiome Project,HMP),旨在推进更先进的微生物领域的发展,包括更新计算分析工工具,临床标准以及建立微生物参考数据库。HMP计划的第一阶段主要是指2007年启动至2016年,第一个十年的研究进展。在该阶段中,研究主要是分析身体五大部位的微生物群体,包括口腔、皮肤、鼻腔、肠胃道和泌尿生殖道,为了探究固定部位的微生物社群是否与人体的特定疾病存在联系。在第一阶段中,HMP制定了五大部位的临床样本标准。除此之外,HMP 还建立了各类微生物的全基因组序列,目前这些序列在NCBI上都能直接获取。

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